学校目前设有基础医学院、临床医学院、针灸推拿康复学院、中药学院、药学院、民族医药学院、护理学院、人文与管理学院、国际教育学院、继续教育学院、信息技术学院等11个学院以及思想政治理论课教学研究部及体育部等2个教学机构。